O monumento foi requalificado depois da autarquia o ter adquirido ao Estado. As obras foram financiadas pelo INAlentejo no âmbito do projecto RUFA – Reabilitação Urbana de Ferreira do Alentejo. A Ermida de São Sebastião funcionará como um pólo do Museu Municipal.
Aníbal Costa, presidente da Câmara de Ferreira do Alentejo, realça que o processo foi “atribulado” pois a autarquia teve que negociar durante vários anos a aquisição da Ermida que por “erro” foi incorporada no património do Estado.