Este Programa foi implementado em 1993 e pretende prevenir a transmissão da infecção do VIH (Vírus da Imunodeficiência Humana) entre utilizadores de drogas injectáveis. Assim é distribuído material esterilizado e recolhido e destruído material utilizado. De acordo com o Conselho Clínico do Departamento Agrupamento dos Centros de Saúde do Baixo Alentejo (DACESBA) o campo de intervenção do programa foi inicialmente limitado às farmácias comunitárias, que terminaram a sua participação no Programa de Troca de Seringas em Dezembro de 2012.
Hoje em dia o Programa é assegurado pelos Centros de Saúde garantindo assim que os utilizadores de drogas injectáveis possam ter acesso ao mesmo em diferentes zonas geográficas do país.
